Protocol ◆ cd16a-spr-kd
协议:CD16a SPR KD 测量——158V vs 158F 同场DRAFT
协议:CD16a SPR KD 测量——158V vs 158F 同场
> 草稿(DRAFT)——文献依据(待湿实验验证)。运行前请与平台科学家确认缓冲液与芯片兼容性。
目的
一次实验内测量测试 IgG1 对 CD16a 158V 与 158F 的 KD/kon/koff,并计算 ΔKD(158V/158F) ratio 用于 allotype 对比。
材料
- CD16a 158V + 158F(ECD,biotinylated,同源表达,allotype 经测序/质谱验证)
- Streptavidin 传感器/芯片(SPR 或 BLI)
- 运行缓冲液:PBS-T(10 mM 磷酸盐、150 mM NaCl、0.05% Tween-20,pH 7.4)
- 分析物:单体 IgG1(如 rituximab/trastuzumab,同一批次);SEC 确认单体
- 对照:参照抗体(同批)、isotype IgG4(阴性对照)
操作步骤
- 低密度捕获:158V 与 158F 各一通道/传感器,biotinylated ECD 捕获;SPR 目标 Rmax 30–80 RU(BLI 0.3–0.8 nm)——防亲合性伪影;
- 平衡:PBS-T pH 7.4 至基线稳定(≥5 min);
- 浓度系列:IgG1 2 倍稀释(覆盖预期 KD 上下 ~10×),≥5 浓度 + 0(对照);
- 结合/解离:30–50 µL/min(SPR)或 100–200 rpm(BLI);结合 120–180 s,解离 180–300 s;参考通道扣减;
- 再生:10 mM glycine pH 2.0–2.5 短脉冲(10–20 s);先验证 ≥5 循环活性稳定;
- 分析:1:1 Langmuir 全局拟合 → KD/kon/koff(两 allotype 各自报告);计算 ΔKD ratio = KD(158F)/KD(158V)。
判读
- 文献报道 158V 对 IgG1 亲和力约为 158F 的 2–5×——你的 ΔKD ratio 应与 datasheet 同数量级,否则查密度/批次;
- 记录绝对 KD 与 ratio;跨实验固定表达系统(HEK293 vs CHO 影响结合)。
故障排查
| 症状 | 原因 | 修复 |
|---|---|---|
| 两 allotype 无差异 | 密度过高掩盖差异/批次混淆 | 降密度;确认 allotype 验证 |
| KD 偏紧 | 密度/二聚 | 低密度;SEC 纯化分析物 |
| 基线漂移 | 再生不足 | 加强再生;验证循环稳定 |
参考文献
- Koene HR, Kleijer M, Algra J, Roos D, von dem Borne AE, de Haas M. FcγRIIIa-158V/F polymorphism influences the binding of IgG by natural killer cell FcγRIIIa, independently of the FcγRIIIa-48L/R/H phenotype. *Blood.* 1997;90(3):1109–1114.
- Wu J, Edberg JC, Redecha PB, et al. A novel polymorphism of FcγRIIIa (CD16) alters receptor function and predisposes to autoimmune disease. *J Clin Invest.* 1997;100(5):1059–1070.
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