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CD47 / SIRPα Hub — 巨噬细胞检查点发现工具DRAFT
CD47 / SIRPα Hub — 巨噬细胞检查点发现工具
> 发布版(六节完整版)。
1. Biology
CD47("don't eat me"信号)广泛表达——包括红细胞——通过结合巨噬细胞上的 SIRPα(CD172a)抑制吞噬。肿瘤上调 CD47 逃避免疫监视;抗 CD47 / 抗 SIRPα 阻断恢复吞噬。该相互作用亲和力低(文献报道 µM 级)、动力学快——与高亲和配对完全不同,实验设计必须区别对待。
- 陷阱:红细胞高表达 CD47;低亲和快动力学(SPR 易伪影);SIRPα V1/V2 异型
- 相关:SIRPα V1/V2、CD47 IgV、CD172a
UniProt 增强(待审校):CD47(Q08722,323 aa);SIRPA(P78324,504 aa) —— 详见 EN Hub(UniProt CC BY 4.0)。
2. Assay Design
| 环节 | 要点 |
|---|---|
| 结合 | 低密度 SPR/BLI(Rmax ≤20 RU)、高流速;报告 KD + kon/koff |
| 阻断 | 竞争 SPR(CD47 + anti-CD47 → SIRPα)与/或细胞吞噬 |
| 红细胞 | 细胞实验彻底清洗;CD47 阴性对照 |
| 异型 | 明确 SIRPα V1/V2——临床相关确认双阻断 |
详细方案:[CD47/SIRPα 阻断三大陷阱](/content/cd47-sirpa-blocking)
3. Construct Selection(CD47/SIRPα)
| 参数 | 选项 | 怎么选 |
|---|---|---|
| CD47 形式 | IgV / 全长 ECD | 结合研究 ECD;表位 IgV 对照 |
| SIRPα variant | V1 / V2 | 明确 allotype;临床相关 → 双 variant |
| 单体性 | 单体 ECD(禁 Fc-fusion) | 只选单体 ECD(SEC 确认) |
| 配对同源性 | 同一供应商 | 同源采购 |
供应商证据:SEC 单体状态、与配对蛋白的 SPR KD(µM 级正常)、SIRPα allotype 声明。
4. Product Comparison(配对)
| 版本 | 适用 | 局限 | 推荐度 |
|---|---|---|---|
| 单体 biotinylated 配对 | SPR/BLI 动力学 + 阻断 | 需验证捕获活性 | ★★★★★ |
| His-tag 单体 | 常规结合/ELISA | anti-His 批次差异 | ★★★★ |
| Fc-fusion 任一 | 细胞实验 | 动力学禁用(假 nM) | ★★ |
4.2 竞品对比(预填,M4 待复核):Sino CD47 12283-H27H-B biotinylated HPLC 验证;ACRO SIRPα V8 MALS 验证(V1 待确认)——价格待询。
5. Protocols
- [CD47–SIRPα SPR 结合与阻断协议](/content/cd47-sirpa-spr-blocking)(文献依据·待验证)
6. FAQ
- 为什么 KD 看着是 nM 但细胞实验不 work? 低亲和 + 高密度 → 亲合性伪影;查密度与 SEC。
- 红细胞干扰怎么破? 纯化蛋白做结合;细胞实验彻底清洗 + 对照。
- SIRPα V1 和 V2 区别? 对 CD47 亲和力不同(文献)、人群分布不同——必须标注。
下一步
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